Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LHCGRP22888 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
LHCGRP22888 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LHCGRP22888 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms