Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
HOXA5P20719 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HOXA5P20719 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms