Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
AMY2BP19961 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
AMY2BP19961 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms