Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VCAM1P19320 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VCAM1P19320 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms