Protein–RNA interactions for Protein: P19013

KRT4, Keratin, type II cytoskeletal 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT4P19013 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
KRT4P19013 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.3■■□□□ 1
KRT4P19013 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KRT4P19013 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KRT4P19013 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KRT4P19013 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT4P19013 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT4P19013 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KRT4P19013 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KRT4P19013 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT4P19013 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms