Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FLT1P17948 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FLT1P17948 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FLT1P17948 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FLT1P17948 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FLT1P17948 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FLT1P17948 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLT1P17948 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FLT1P17948 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms