Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GJA1P17302 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
GJA1P17302 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA1P17302 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA1P17302 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
GJA1P17302 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
GJA1P17302 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GJA1P17302 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJA1P17302 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJA1P17302 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJA1P17302 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms