Protein–RNA interactions for Protein: P17174

GOT1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOT1P17174 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOT1P17174 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOT1P17174 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOT1P17174 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOT1P17174 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOT1P17174 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOT1P17174 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms