Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CCL3L1P16619 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CCL3L1P16619 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.1 ms