Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP2A2P16615 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP2A2P16615 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATP2A2P16615 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms