Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VAV1P15498 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VAV1P15498 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAV1P15498 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VAV1P15498 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms