Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CPA1P15085 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CPA1P15085 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CPA1P15085 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CPA1P15085 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CPA1P15085 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA1P15085 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA1P15085 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA1P15085 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CPA1P15085 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA1P15085 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA1P15085 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CPA1P15085 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CPA1P15085 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms