Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GABRA1P14867 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GABRA1P14867 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms