Protein–RNA interactions for Protein: P12829

MYL4, Myosin light chain 4, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL4P12829 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MYL4P12829 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MYL4P12829 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MYL4P12829 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYL4P12829 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYL4P12829 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYL4P12829 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MYL4P12829 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MYL4P12829 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MYL4P12829 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MYL4P12829 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MYL4P12829 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYL4P12829 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYL4P12829 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYL4P12829 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYL4P12829 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MYL4P12829 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms