Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PGA3P0DJD8 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms