Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ITGAVP06756 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGAVP06756 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGAVP06756 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms