Protein–RNA interactions for Protein: P06727

APOA4, Apolipoprotein A-IV, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA4P06727 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.29■■□□□ 1
APOA4P06727 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
APOA4P06727 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
APOA4P06727 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
APOA4P06727 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
APOA4P06727 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
APOA4P06727 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
APOA4P06727 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
APOA4P06727 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms