Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
APOC3P02656 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
APOC3P02656 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC3P02656 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
APOC3P02656 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
APOC3P02656 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOC3P02656 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOC3P02656 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms