Protein–RNA interactions for Protein: P02585

TNNC2, Troponin C, skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNC2P02585 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
TNNC2P02585 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TNNC2P02585 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms