Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ASS1P00966 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ASS1P00966 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ASS1P00966 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ASS1P00966 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ASS1P00966 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ASS1P00966 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ASS1P00966 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ASS1P00966 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms