Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZBED1O96006 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED1O96006 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
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