Protein–RNA interactions for Protein: O95707

POP4, Ribonuclease P protein subunit p29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP4O95707 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
POP4O95707 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
POP4O95707 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
POP4O95707 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
POP4O95707 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
POP4O95707 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
POP4O95707 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP4O95707 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP4O95707 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
POP4O95707 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
POP4O95707 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms