Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BRD1O95696 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BRD1O95696 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BRD1O95696 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BRD1O95696 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BRD1O95696 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms