Protein–RNA interactions for Protein: O95155

UBE4B, Ubiquitin conjugation factor E4 B, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4BO95155 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
UBE4BO95155 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBE4BO95155 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms