Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRPF6O94906 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRPF6O94906 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms