Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GABBR2O75899 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GABBR2O75899 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms