Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RPS6KA4O75676 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RPS6KA4O75676 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RPS6KA4O75676 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms