Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC45O75419 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC45O75419 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDC45O75419 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDC45O75419 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CDC45O75419 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDC45O75419 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDC45O75419 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms