Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PPFIA3O75145 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPFIA3O75145 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms