Protein–RNA interactions for Protein: O60830

TIMM17B, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17-B, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17BO60830 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TIMM17BO60830 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TIMM17BO60830 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
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TIMM17BO60830 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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TIMM17BO60830 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
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TIMM17BO60830 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TIMM17BO60830 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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