Protein–RNA interactions for Protein: O60504

SORBS3, Vinexin, humanhuman

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORBS3O60504 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORBS3O60504 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SORBS3O60504 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms