Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXTL3O43909 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms