Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CREB3O43889 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CREB3O43889 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CREB3O43889 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CREB3O43889 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CREB3O43889 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms