Protein–RNA interactions for Protein: O43854

EDIL3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDIL3O43854 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
EDIL3O43854 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EDIL3O43854 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms