Protein–RNA interactions for Protein: O43815

STRN, Striatin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRNO43815 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
STRNO43815 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
STRNO43815 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
STRNO43815 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRNO43815 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRNO43815 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRNO43815 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRNO43815 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
STRNO43815 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
STRNO43815 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
STRNO43815 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
STRNO43815 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
STRNO43815 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
STRNO43815 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms