Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CYTH3O43739 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CYTH3O43739 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms