Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ACTN4O43707 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN4O43707 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ACTN4O43707 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN4O43707 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN4O43707 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ACTN4O43707 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms