Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCXO43602 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DCXO43602 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCXO43602 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCXO43602 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCXO43602 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCXO43602 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCXO43602 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCXO43602 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms