Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
KCNQ3O43525 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
KCNQ3O43525 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms