Protein–RNA interactions for Protein: O43424

GRID2, Glutamate receptor ionotropic, delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRID2O43424 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRID2O43424 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRID2O43424 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GRID2O43424 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GRID2O43424 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID2O43424 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID2O43424 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
GRID2O43424 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GRID2O43424 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GRID2O43424 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID2O43424 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GRID2O43424 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms