Protein–RNA interactions for Protein: O43374

RASA4, Ras GTPase-activating protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA4O43374 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA4O43374 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA4O43374 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA4O43374 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA4O43374 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RASA4O43374 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RASA4O43374 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RASA4O43374 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RASA4O43374 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RASA4O43374 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RASA4O43374 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms