Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
MTSS1O43312 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MTSS1O43312 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms