Protein–RNA interactions for Protein: O43303

CCP110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCP110O43303 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCP110O43303 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCP110O43303 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCP110O43303 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCP110O43303 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCP110O43303 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms