Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPAA1O43292 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPAA1O43292 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms