Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.242e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 TRIB1-203ENST00000520847 1332 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 PRMT7-213ENST00000564441 1011 ntTSL 312.99□□□□□ -0.332e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 SDCCAG8-201ENST00000366541 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 CPT1A-201ENST00000265641 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.642e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 PRMT7-218ENST00000566341 562 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 GON4L-218ENST00000620426 5506 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 GON4L-219ENST00000622608 4801 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -12e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 PRMT7-204ENST00000561806 543 ntTSL 58.23□□□□□ -1.092e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 GCNA-202ENST00000373696 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.112e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.691e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.42e-10■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 TBL1X-202ENST00000380961 4674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-10■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 TBL1X-206ENST00000424279 5451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.392e-10■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.573e-6■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.665e-7■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.452e-6■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.142e-6■■■■□ 23.1
PRPF4O43172 KAT5-211ENST00000532042 763 ntTSL 215.48■□□□□ 0.072e-6■■■■□ 23.1
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PRPF4O43172 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.391e-8■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 ZFC3H1-212ENST00000552994 7597 ntTSL 1 (best)13.08□□□□□ -0.321e-8■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.321e-8■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 ZFC3H1-208ENST00000550712 571 ntTSL 45.76□□□□□ -1.491e-8■■■■□ 22.9
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PRPF4O43172 KCTD21-206ENST00000530018 559 ntTSL 411.41□□□□□ -0.582e-6■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 KCTD21-201ENST00000340067 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.672e-6■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 KCTD21-204ENST00000528776 538 ntTSL 47.87□□□□□ -1.152e-6■■■■□ 22.9
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PRPF4O43172 GPS1-212ENST00000580716 567 ntTSL 416.57■□□□□ 0.244e-7■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 PAQR8-201ENST00000360726 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.651e-7■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 CDRT4-203ENST00000524205 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 29.84□□□□□ -0.837e-7■■■■□ 22.9
PRPF4O43172 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.582e-6■■■■□ 22.8
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