Protein–RNA interactions for Protein: O15534

PER1, Period circadian protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER1O15534 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PER1O15534 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PER1O15534 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PER1O15534 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PER1O15534 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PER1O15534 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PER1O15534 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PER1O15534 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PER1O15534 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PER1O15534 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PER1O15534 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PER1O15534 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PER1O15534 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms