Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ARPC1BO15143 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ARPC1BO15143 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms