Protein–RNA interactions for Protein: O15047

SETD1A, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1AO15047 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
SETD1AO15047 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
SETD1AO15047 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
SETD1AO15047 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms