Protein–RNA interactions for Protein: O00628

PEX7, Peroxisomal targeting signal 2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX7O00628 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PEX7O00628 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX7O00628 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX7O00628 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX7O00628 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PEX7O00628 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms