Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
AGRNO00468 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
AGRNO00468 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AGRNO00468 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AGRNO00468 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms